第1部 プロローグ
プロローグ
連邦生徒会 · ミレニアム · ゲヘナ · トリニティ
Vol.1 対策委員会編 1章
対策委員会の奇妙な一日
アビドス · ゲヘナ · トリニティ
桜花爛漫お祭り騒ぎ！～空に徒花 地に忍び～
百鬼夜行
Vol.1 対策委員会編 2章
失ったもの、手放さなかったもの
アビドス · ゲヘナ · トリニティ
Vol.2 時計じかけの花のパヴァーヌ編 1章
レトロチック・ロマン
ミレニアム
革命のイワン・クパーラ 髭とプリンとレッドウィンター
レッドウィンター
Vol.3 エデン条約編 1章
補習授業、スタート！
トリニティ
夏空のウィッシュリスト
トリニティ
～風紀委員会行政官緊急特務命令～ヒナ委員長のなつやすみっ！
ゲヘナ
ネバーランドでつかまえて
山海経
船上のバニーチェイサー
ミレニアム · オデッセイア
Vol.3 エデン条約編 2章
不可能な証明
トリニティ · ゲヘナ
EX. デカグラマトン編 1章
知恵の蛇
ミレニアム
227号温泉郷の運営記録！～白い吐息は寄り添って～
レッドウィンター
Vol.3 エデン条約編 3章
私たちの物語
トリニティ · ゲヘナ · アリウス · アビドス
新春狂想曲第68番
ゲヘナ · アビドス
シャーレのハッピー♡バレンタインパトロール
ヴァルキューレ · 百鬼夜行
狐坂ワカモの沈黙と祝宴
ヴァルキューレ · 百鬼夜行
どたばたシスターと古書館の魔術師
トリニティ
Vol.4 カルバノグの兎編 1章
RABBIT小隊始動！
SRT · ヴァルキューレ · 連邦生徒会
不忍ノ心
百鬼夜行 · ゲヘナ
Vol.3 エデン条約編 4章
忘れられた神々のためのキリエ
トリニティ · アリウス
アビドスリゾート復旧対策委員会
アビドス
出張！百夜堂海の家FC計画
百鬼夜行 · アビドス
放課後スイーツ物語 甘い秘密と銃撃戦
トリニティ
ON YOUR MARK @ MILLENNIUM～キヴォトス晄輪大祭～
ミレニアム
Get Set, Go!～キヴォトス晄輪大祭～
ミレニアム · トリニティ · ゲヘナ · アビドス · 百鬼夜行 · SRT
Vol.2 時計じかけの花のパヴァーヌ編 2章
友情と勇気と光のロマン
ミレニアム
聖堂のメリークリスマス ～救護騎士団の贈り物～
トリニティ
喰積の前にいささか 一番勝負
ゲヘナ
Final. あまねく奇跡の始発点 1章
シャーレ奪還作戦
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Final. あまねく奇跡の始発点 2章
虚妄のサンクトゥム攻略戦
連邦生徒会 · アビドス · ゲヘナ · トリニティ · ミレニアム · 百鬼夜行 · レッドウィンター · ヴァルキューレ · SRT · 山海経 · アリウス
Final. あまねく奇跡の始発点 3章
アトラ・ハシースの箱舟占領戦
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Final. あまねく奇跡の始発点 4章
プレナパテス決戦
連邦生徒会 · アビドス · ゲヘナ · トリニティ · ミレニアム · 百鬼夜行 · レッドウィンター · ヴァルキューレ · SRT · 山海経 · アリウス
白亜の予告状～虚飾の館と美学の在り処～
ミレニアム
龍武同舟 ～思い描くは、ひとつの未来～
山海経
Vol.4 カルバノグの兎編 2章
We Were RABBITs!
SRT · 連邦生徒会 · ヴァルキューレ
夏の特殊作戦！RABBIT小隊と消えたエビの謎
SRT
隠されし遺産を求めて～トリニティの課外活動～
トリニティ
学漫同人物語 ～2人が求める最終回～
レッドウィンター
Trip-Trap-Train
トリニティ · ゲヘナ
Vol.5 百花繚乱編 1章
いつかの芽吹きを待ち侘びて
百鬼夜行
(電脳)新春行進曲
ミレニアム
陽ひらく彼女たちの小夜曲
ゲヘナ
Vol.1 対策委員会編 3章
夢が残した足跡
アビドス · ハイランダー · ゲヘナ
0068 オペラより愛をこめて！
ゲヘナ · アリウス
にぎにぎと ゆきゆきて
百鬼夜行 · ゲヘナ
-ive aLIVE!
トリニティ · ワイルドハント
Say-Bing!
ヴァルキューレ
Sheside Outside
アリウス
月華夢騒
山海経 · レッドウィンター
五塵来降
山海経
Serenade Promenade
トリニティ · アビドス · ヴァルキューレ · ミレニアム · 百鬼夜行
EX. デカグラマトン編 2章
炎の剣
ミレニアム
秘密のミッドナイトパーティー ～オニの手は鐘と共に～
ミレニアム
Code: BOX ミレニアムに迫る影 ～一つの問いと二つの答え～
ミレニアム · トリニティ
パンデミック・ハザード ～奇跡の一枚～
ゲヘナ
プレイボール！～目指せ！満塁ホームラン～
ミレニアム
ハイランダー鉄道爆走事件 〜そして列車はなくなった〜
ハイランダー · ゲヘナ
Vol.5 百花繚乱編 2章
孤独に花を咲かせんとする君へ
百鬼夜行
百ヨリ出ズル一輪ノ ～いざ尋常に、水上勝負～
百鬼夜行
夏空のやくそく
トリニティ · ゲヘナ
我らオカルト研究会！～学院の不思議と古の呪文～
ワイルドハント
Vol.6 過ぎ去りし刻のオラトリオ編 1章
見えない私たちの境界線
アリウス · トリニティ
誰が為の芸術 ～偽飾の絵画と美学の行方～
ワイルドハント
Vol.6 過ぎ去りし刻のオラトリオ編 2章
あの刻に告げし決別
アリウス · トリニティ
魔法少女ヘヴィキャリバー～エラの野望と正義の資格～
トリニティ · ミレニアム
Vol.6 過ぎ去りし刻のオラトリオ編 3章
遺された未来のためのエクレシア
アリウス · トリニティ
冬空の文芸復興～健全なる文化の交流について～
レッドウィンター · トリニティ
不忍ノ道 ～ファッションショー警護任務！の巻～
百鬼夜行
EX. デカグラマトン 3章
不離一体の空
ミレニアム
キヴォトス・未確認ミステリー～邪を払うツチノコ大調査～
ミレニアム
第2部 プロローグ
プロローグ
連邦生徒会
Vol.0 連邦生徒会編 1章
アーモンドの花咲く春の日に
連邦生徒会
EX. ロア追跡編 1章
正午の陽炎
SRT · 連邦生徒会 · ゲヘナ